Fraîchement arrivée à Tokyo depuis sa région natale, Meiko, nouvelle élève de l’école de jeunes filles Amamiya, se rend au dortoir du lycée pour s’y installer. Cependant, l’endroit, qui est aussi un manga café, est très différent de ce qu’elle imaginait. Elle y rencontre la gérante Rie Amamiya et ses autres camarades de dortoir, puis commencent la nouvelle année scolaire à leurs côtés.